㈜아토매트릭스는 AI와 분자동역학(MD)을 활용한 컴퓨터 기반 신약설계(CADD) 전문기업입니다. GPCR 등 고난도 막단백질 표적에 특화된 CANDDIE™ 플랫폼을 개발, 보하고 있으며, 막단백질 모델링, 후보물질 선별, Docking, MD simulation, 결합친화도 및 결합 후 신호전달 분석을 하나의 워크플로우로 연결, 분석하여 후보물질 우선순위 선정을 지원합니다. 현재 국내 제약사를 대상으로 CANDDIE 기반 유료 B2B 신약설계 연구서비스를 수행하고 있으며, 고객 프로젝트에서 축적한 계산조건과 사용자 요구사항을 바탕으로 글로벌 플랫폼 서비스를 위한 CANDDIE SaaS 제품 개발(2027년 1Q 공개 예정)을 함께 진행하고 있습니다.

아토매트릭스의 CANDDIE™는 GPCR 등 고난도 막단백질 표적에 특화된 AI·분자동역학(MD) 기반 신약설계 플랫폼입니다. 표적 구조모델링, Virtual Screening/Docking, MD, Post-MD 분석을 하나의 workflow로 통합해 일반 신약연구자와 CADD 전문가가 모두 활용할 수 있도록 설계되었습니다. 특히 Post-MD 단계에서는 BARon™이 MD 기반 결합친화도와 동적 결합 안정성을 평가해 후보물질 우선순위 선정을 지원하고, Allopiper™가 약물 결합 후 allostery와 신호전달 관련 구조변화를 분석해 작용기전 기반 후보물질 차별화를 지원합니다. 이를 통해 결합특성과 작용기전 차이를 함께 고려한 효율적인 후보물질 선정이 가능합니다. 현재 국내 제약·바이오기업의 유료 B2B 프로젝트에 적용 중이며, 2026년 4분기 SaaS Beta, 2027년 1분기 정식 출시를 추진하고 있습니다.